Το Αρχαιολογικό Μουσείο Ηγουμενίτσας βρίσκεται επί της παραλιακής οδού (παλαιά Ε.Ο. Ηγουμενίτσας-Ιωαννίνων) έναντι του Τ.Ε.Ι. Ηπείρου και του δημοτικού σταδίου Ηγουμενίτσας.

Στο Αρχαιολογικό Μουσείο Ηγουμενίτσας μπορεί κανείς να φτάσει:

Με αυτοκίνητο 

Έξω από το μουσείο υπάρχει δωρεάν δημοτικό πάρκινγκ και άλλοι χώροι στάθμευσης στην ευρύτερη περιοχή.

Με τα πόδια

Απέχει 15΄ από το κέντρο της πόλης (πλατεία Δημαρχείου) και 30΄ από τις εγκαταστάσεις του Κεντρικού  Επιβατικού Σταθμού του Νέου Λιμένα Ηγουμενίτσας.

Το μουσείο είναι προσβάσιμο από άτομα με ειδικές ανάγκες (ΑΜΕΑ): υπάρχει ράμπα πρόσβασης στην είσοδο, ενώ η περιήγηση στην έκθεση και στους χώρους του μουσείου υποστηρίζεται από ανελκυστήρα. Ειδικές ρυθμίσεις έχουν γίνει και στους χώρους υγιεινής.