Το Αρχαιολογικό Μουσείο Ηγουμενίτσας βρίσκεται επί της παραλιακής οδού (παλαιά Ε.Ο. Ηγουμενίτσας-Ιωαννίνων) έναντι του Τ.Ε.Ι. Ηπείρου και του δημοτικού σταδίου Ηγουμενίτσας.
Στο Αρχαιολογικό Μουσείο Ηγουμενίτσας μπορεί κανείς να φτάσει:
Με αυτοκίνητο
Έξω από το μουσείο υπάρχει δωρεάν δημοτικό πάρκινγκ και άλλοι χώροι στάθμευσης στην ευρύτερη περιοχή.
Με τα πόδια
Απέχει 15΄ από το κέντρο της πόλης (πλατεία Δημαρχείου) και 30΄ από τις εγκαταστάσεις του Κεντρικού Επιβατικού Σταθμού του Νέου Λιμένα Ηγουμενίτσας.
Το μουσείο είναι προσβάσιμο από άτομα με ειδικές ανάγκες (ΑΜΕΑ): υπάρχει ράμπα πρόσβασης στην είσοδο, ενώ η περιήγηση στην έκθεση και στους χώρους του μουσείου υποστηρίζεται από ανελκυστήρα. Ειδικές ρυθμίσεις έχουν γίνει και στους χώρους υγιεινής.